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藥學系以「培育優良藥師、力行創新服務、服務社會人群、及奉獻領導藥界」為中心思想，將創系系主任孫雲燾教授所說「藥能壽世，學以惠民；十年樹木，百年樹人。藥學教育濟世惠民，任重道遠。」作為座右銘。

本系是國內南部第一所位於綜合大學校園內的醫學院，師資及課程安排多元化，是一所注重人文修養與藝術薰陶的醫學院。本系有周密的導師制度，學生在課業及生活上收到良好的照顧。此外，本校醫學院與醫院毗鄰而社，基礎與臨床教育融合一體，為一所學術自由、創造力蓬勃的醫學院。

藥學系指與藥物相關的科學領域，包括新藥的研發、藥品的製造與品質管制、調劑與臨床藥學、藥事行政與法規以及藥物經濟等。

醫學系是進行有關醫學的研究和教育的學系，主要分為臨床學科及基礎學科。

本系部份課程如調劑學暨臨床藥學等，必須具備色彩觀察及辨識能力。
部分課程以小組討論進行，宣具有人際互動、溝通協調之能力。
部分臨床課程須久站以照顧病人、具備抗壓能力、與醫療團隊溝通、建立醫病關係等，必需具備適當之視覺、聽覺、口語表達、溝通以及個人安全維護的能力。

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關於準備資料，你需要知道的事—各審查項目之審查目的
1.
修課紀錄：瞭解基礎學科能力、修課紀錄與學習歷程多元表現。
2.
課程學習成果：檢視學習脈絡、自主學習與成長體驗。
3.
多元表現：瞭解探索個人特質與發掘潛力的過程及結果。
4.
學習歷程自述：瞭解在學習過程中，自我探索及反思。

藥學系為唯一畢業後具有參加藥師執照考試資格的學系。 藥理學或是生物藥學系的學習內容則是以生物醫學相關科目為主，畢業後不能報考藥師執照考試，亦無新藥研發與藥品製造的相關專業科目。

本系課程包含基礎課程與臨床課程，日後可選擇的科別較多，如神經科學、呼吸循環、肝膽腸胃、骨骼關節等；而牙醫系在未來執業時則較侷限。

不同於醫學院的其他科系，畢業生的主要工作地點為醫療機構；臺大藥學系畢業生的出路不限於醫院與診所，生涯發展的範圍遍及產官學研各領域，具有最多元最寬廣的發展空間。

未來出路並非只能當醫師：取得醫師執照後，可執業，或就讀研究所。於臨床醫學部分，可選考臨床醫學研究所進修；於基礎醫學部分則可選考醫學院各學科研究所進修；畢業後未來亦可投身進入公共衛生相關領域，成為政府衛生行政官員或大型醫院之專業管理人；另外亦可進入目前最熱門的生物科技產業進行研發工作，成為明日之星。

除了參加藥師執照考試資格的相關科目外，臺大藥學系的學習內容同時包括完整的新藥研發、藥品製造與品管、藥事行政與法規以及藥物經濟等科目，亦即涵蓋醫院、產官學研各方面的藥學知識。

不是學醫的人，對於什麼科看什麼病、或什麼病該看什麼科一頭霧水。醫學專科分科越來越細，每個專科都有專業的學問和技能，2013年醫學系教育改為六年制加上二年期PGY，採一般醫學內科、一般醫學外科、一般醫學兒科及一般醫學婦產科四分組訓練，醫師可依個人志向選擇組別，再次強化一般醫學照護病人的能力。

臺大藥學系為國內唯一課程設計採多軌制的藥學科學相關科系，學生可依據性向選擇：一、醫院臨床藥學；二、藥學研究；三、藥廠或藥商；四、藥政管理；其中之一做為主要實習內容，並銜接未來個人之中長程生涯發展規劃。

本系位於綜合大學校園內，師資及課程安排多元化，在課程精進計畫下，本系減少必修課程，增加學生自由選課之空間，鼓勵學生發展第二專業，申請修讀雙主修或輔系，強化未來的競爭力；在課餘，亦鼓勵學生多方參與社團活動或課外活動，豐富大學生活。