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本系特色如下:
1. 優異師資陣容，領域橫跨放射技術、生物、化學、物理、影像處理、硬體開發
2. 低生師比及導師制度，專任教師平均年齡低於50歲，有利師生溝通
3. 與國內外頂尖實驗室研究接軌，具高競爭力
4. 鼓勵雙語學習，有利與國際接軌
5. 完整的系友會組織，提供學生未來就學就業諮詢
6. 可修讀陽明交大各校區課程，鼓勵跨域學習

藥學系以「培育優良藥師、力行創新服務、服務社會人群、及奉獻領導藥界」為中心思想，將創系系主任孫雲燾教授所說「藥能壽世，學以惠民；十年樹木，百年樹人。藥學教育濟世惠民，任重道遠。」作為座右銘。

本系系名意旨應用游離及非游離輻射於形成醫學影像或應用於疾病治療，為現今醫學領域不可或缺之領域。以放射物理、放射化學、放射生物、輻射防護等學科為基礎，近一步接觸臨床技術、儀器設計原理、影像分析處理、核醫藥物開發等學習。以解決問題為學習導向，涵蓋跨領域之理論與實務設計，強調轉譯醫學及診療合一的教學研究，以訓練具獨立思考及操作能力之人才。

藥學系指與藥物相關的科學領域，包括新藥的研發、藥品的製造與品質管制、調劑與臨床藥學、藥事行政與法規以及藥物經濟等。

學習領域廣泛，課堂主要教授重要概念及技術，學生需具自我學習動機及能力；由於學習內容豐富，學生亦需具備歸納與融會貫通的能力，以順利銜接大學課程。放射科學包含基礎研究及應用，因此除著重學科知識外，更需深究其應用面，了解各種影像、治療等與基礎知識的關聯性。除強調基礎原理外，亦鼓勵學生可透過專題研究來加強發現問題、解決問題，以及統整消化資訊的能力，同時也能培養動手做的實力；此外，與國際接軌為未來需要具備的能力之一，因此需要提升英文的聽說讀寫能力，以降低修讀EMI課程的壓力，並可多接觸國際事務文化，增加自我的國際移動力。醫療服務及研究皆需團隊合作及溝通協調，鼓勵學生多參與團隊活動及志工服務，從過程中獲得相關經驗及反思。

本系部份課程如調劑學暨臨床藥學等，必須具備色彩觀察及辨識能力。
部分課程以小組討論進行，宣具有人際互動、溝通協調之能力。
部分臨床課程須久站以照顧病人、具備抗壓能力、與醫療團隊溝通、建立醫病關係等，必需具備適當之視覺、聽覺、口語表達、溝通以及個人安全維護的能力。

醫放系學習領域：醫學物理、醫學影像、輻射生物與核醫藥物，橫跨基礎與臨床放射科學，畢業並取得相關證照資格後，可至臨床擔任放射師、物理師，藉提供優良之醫學影像及治療計畫協助診斷治療；經深造亦有機會進入醫療儀器產業、生技製藥公司、公職單位就業。

醫技系: 醫檢師，協助臨床診斷。物治系: 物理治療師，解決病患動作問題、改善生活品質。

藥學系為唯一畢業後具有參加藥師執照考試資格的學系。 藥理學或是生物藥學系的學習內容則是以生物醫學相關科目為主，畢業後不能報考藥師執照考試，亦無新藥研發與藥品製造的相關專業科目。

本系畢業生出路廣泛，不僅可至各醫療院所執行臨床業務，亦可進入相關影像診斷、放射治療儀器公司，或核醫藥物製備公司。此外有不少系友進入資訊、工程等領域，擔任軟硬體工程師；亦有系友致力於生技製藥領域或往教研領域發展。因具專業背景，本系畢業生也可藉專技國家考試進入政府機關擔任公務人員。

不同於醫學院的其他科系，畢業生的主要工作地點為醫療機構；臺大藥學系畢業生的出路不限於醫院與診所，生涯發展的範圍遍及產官學研各領域，具有最多元最寬廣的發展空間。

畢業後只能當醫事放射師到臨床服務? 本系統計結果: 三成系友畢業後直接進入醫療職場工作，七成校友透過在學期間漸進但扎實的學識能力養成，後續於台灣或國外升學深造，爾後進入資訊、工程、生物科技、藥學等領域發展，擔任工程師、研發或教職人員。畢業生亦可透過國家公職考試成為服務於專業領域之公務人員。

除了參加藥師執照考試資格的相關科目外，臺大藥學系的學習內容同時包括完整的新藥研發、藥品製造與品管、藥事行政與法規以及藥物經濟等科目，亦即涵蓋醫院、產官學研各方面的藥學知識。

本系為四年制學士學位，期望訓練具扎實基礎及專業知識之人才。鼓勵同學進入實驗室探索方向，提供企業實習機會，大四主要為實習課程，提早體會未來可能職場。提供國際交流機會，參訪國內相關企業，舉辦職涯講座，協助學生依個人特質及興趣，找到職涯方向。於產官學醫界皆有表現傑出之系友，可做為學生未來諮詢之後盾。亦設有五年一貫學碩士學制，提供對科研有興趣同學另一選擇。

臺大藥學系為國內唯一課程設計採多軌制的藥學科學相關科系，學生可依據性向選擇：一、醫院臨床藥學；二、藥學研究；三、藥廠或藥商；四、藥政管理；其中之一做為主要實習內容，並銜接未來個人之中長程生涯發展規劃。