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本系之研究領域除灌溉排水技術外，尚包括農業災害防治、注重生態環境發展、生物環境工程技術及農村環境規劃等。

本系提供尖端科技關鍵產業之跨領域教學與研究，設有光機電資訊與船舶海洋應力計算等二大領域，學生於大二自由選擇一領域主修。近年肩負國艦國造、離岸風力發電、智慧機械等重點產業之發展重任，畢業生皆能於半導體、光電、電機、電子、資訊、離岸風力發電、智慧機械、船舶及海洋科技領域深造與就業，多元發展，出路極佳！

生工系為「建構永續環境的工程師」：更進一步脫離傳統以「人」為主的工程思維，往「環境」的評估與規劃發展，嘗試以系統性的工程方法解決問題。

「工程科學」為工程及科學的結合，科技與系統整合係工程科學主要目標，本系的教學研究特色為科技與系統整合，強調具備科技與系統能力的跨領域專業科技人才培育，教學研究領域涵蓋「光機電資訊」與「船海應力計算領域」兩大領域。

大學實驗課程除了重視實驗過程之細節外，更重視實驗結果之分析與問題檢討，未必會有標準答案，建議高中同學藉由實驗課程培養驗證科學之精神及問題探討。另本系致力於培育具有分析、創新及解決問題能力，並具備健全品格及關懷社會及生物資源與農業科學之專業科技人才，建議同學除了認真學習高中學業外，亦要時時關注與自身息息相關之各項議題，發現問題，結合本系相關課程及專題研究尋求問題之解答，並學習解決問題之能力，以充實自己。

本系著重於數學、物理、等領域科目及加深加選選修表現。高中在學期間與工程科學及海洋工程領域相關科目之書面報告、自然科學領域探究與實作成果，或特殊類型班級之相關課程學習成果。

生工與生命科學：生工是「工程」，目標是結合工程與生態的概念，因此我們關心的是整體生態系統是否受到影響，在開發同時也能維持永續經營。而生科是「科學」，目標是了解各種生物體的特性與各種生物之間的差異。
生工系與生物工程：生工系主要研究工程對環境的影響，營造永續環境；生物工程則是將數、物、化等學科結合生物學，應用於醫學、食品等等。

工科海洋系與機械系、電機系等相關科系的不同在於本系著重跨領域學習，課程涵蓋機械、電機、海洋工程之跨領域整合。

本系課程規畫以畢業後能考取「水利工程」技師以及「水土保持」技師為主，而「建築」相關課程雖在本系有開設永續綠建築、建築環境控制等課程，但本系建築課程之學分並無達到建築技師之最低要求。

1.學生易混淆本系畢業生只能從事船舶海洋工程領域相關工作
2.本系未來出路涵蓋非常廣，如學術法人研究機構、高科技電機電 子產業、機電資訊、離岸風電、船舶遊艇、航運等，國內外產業就業機會極佳。

系名的「生物」是指「生物環境的」（Bioenvironmental），致力於評估營造友善生物環境的工程，主軸仍在工程上。儘管研究重點不在生物上，但我們仍需要相關的基本知識，因此必修課中才要上普通生物學丙學習最基礎的知識、生態學則教會我們生物與環境之間的關係。

本系教學目標乃在提供跨專業及跨領域科技之基礎工程教育，以及多種專業學程學習環境。同時並融入總整式課程，重視理論與實務整合訓練。

請參閱本系高中生專區網頁：https://ntubse.github.io/introduction/index.html

本系就工學院其他科系而言更加著重於跨領域學習，課程涵蓋完整電機系主要課程，完整機械主要力學課程以及海洋工程相關課程。在學程規劃上，大一大二以基礎課程為主，其中各教學領域擬定一至二門必修課，除可協助學生選擇志向外，也具促成跨專長與跨領域之教學目的，大二以後，學生可依自己的興趣選擇主修專業領域及副修專業領域，成為具備科技與系統整合能力的跨領域專業科技人才。